Trong thời gian xảy ra ba vụ dịch cúm gia cầm từ đầu năm 2004 tới tháng 6 năm 2005, phòng thí nghiệm SINH HỌC PHÂN TỬ –VIỆN PASTEUR TP HCM đã tiến hành giám sát sự biến đổi của virus cúm H5N1 độc lực cao và giải mã toàn bộ bộ gen của 24 mẫu virút gây bệnh ở các loài gia cầm, thủy cầm và người tại các tỉnh phía Nam. Kết quả giải mã cho thấy tất cả các chủng virút gây dịch năm 2005 về cơ bản vẫn rất giống với virus lưu hành năm 2004 trong khu vực. Tuy nhiên, chủng virút H5N1 trên người, thuỷ cầm đầu năm 2005 đã có một số đột biến tập trung vào những vùng chức năng quan trọng của kháng nguyên bề mặt. Đã xuất hiện đột biến cho phép virút sinh sản hiệu quả trên tế bào động vật có vú và mang độc tính cao. Toàn bộ các chủng Việt Nam trong nghiên cứu đều có đột biến làm chủng kháng với Amantadine. Bước đầu đã phát hiện khả năng kháng Tamiflu trên một mẫu virus gây bệnh trên người đầu năm 2005. Việc giám sát virút kháng Oseltamivir (Tamiflu) cũng như việc tích trữ các thuốc kháng virút hiệu quả mới là cần thiết và cấp bách.
